La Dirección de Innovación tiene como función implementar y monitorear las acciones derivadas de la política institucional relativas al desarrollo y la innovación en todos los campos disciplinarios, articulando la transferencia de los resultados de la investigación con la demanda efectiva nacional e internacional y estableciendo mecanismos de apoyo a la comunidad universitaria.

La Dirección de Innovación dispone de una Subdirección de Innovación, además depende de esta dirección: la Oficina de Transferencia y Licenciamiento (OTL), la Unidad de Proyectos y la Unidad de Emprendimiento.